52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1416 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  100 
 
 		 829 aa  1687    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  26.25 
 
 		 796 aa  177  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  27.64 
 
 		 761 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  27.52 
 
 		 761 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  27.48 
 
 		 761 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  27.6 
 
 		 759 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  23.6 
 
 		 732 aa  128  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  22.56 
 
 		 878 aa  127  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  23.77 
 
 		 838 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  23.83 
 
 		 696 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  24.18 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  26.37 
 
 		 692 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  24.54 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  26.15 
 
 		 692 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  22.62 
 
 		 689 aa  67.8  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  22.8 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  24.07 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  24.81 
 
 		 693 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  23.54 
 
 		 696 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  23.39 
 
 		 691 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  26.67 
 
 		 696 aa  63.9  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  24.36 
 
 		 731 aa  63.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  25.54 
 
 		 687 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  21.81 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  25.54 
 
 		 724 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  21.75 
 
 		 689 aa  61.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2313  hypothetical protein  22.65 
 
 		 770 aa  61.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  23.26 
 
 		 690 aa  60.8  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  21.9 
 
 		 689 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  23.58 
 
 		 687 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  27.07 
 
 		 688 aa  60.1  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  22.69 
 
 		 690 aa  60.1  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  23.27 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  23.49 
 
 		 687 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  25.53 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  30.22 
 
 		 712 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  25.19 
 
 		 689 aa  57  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  24.37 
 
 		 688 aa  55.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  23.21 
 
 		 687 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  23.79 
 
 		 687 aa  54.7  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  23.02 
 
 		 687 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  21.76 
 
 		 687 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  22.83 
 
 		 691 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  24.87 
 
 		 694 aa  50.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  21.27 
 
 		 687 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  24.23 
 
 		 951 aa  50.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  24.5 
 
 		 700 aa  49.3  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  23.54 
 
 		 670 aa  48.9  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  26.07 
 
 		 932 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 		 936 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  30.99 
 
 		 680 aa  44.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  27.08 
 
 		 695 aa  44.3  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>