82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1891 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 932 aa  1814    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  72.13 
 
 		 936 aa  1230    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  39.87 
 
 		 958 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  39.02 
 
 		 966 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  38.22 
 
 		 978 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  39.32 
 
 		 972 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  37.45 
 
 		 950 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  37.22 
 
 		 914 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  32.45 
 
 		 918 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  32.84 
 
 		 951 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 		 902 aa  287  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 		 888 aa  275  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 		 828 aa  275  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 		 903 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  29.04 
 
 		 1023 aa  267  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 847 aa  251  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 		 851 aa  239  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.1 
 
 		 842 aa  202  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 		 859 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 744 aa  118  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  23.99 
 
 		 717 aa  97.8  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  23.49 
 
 		 813 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  24.47 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  28.34 
 
 		 571 aa  70.5  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.68 
 
 		 419 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 		 562 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  27.71 
 
 		 350 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 		 561 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 415 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 588 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 418 aa  52.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 698 aa  51.6  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 		 640 aa  50.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 328 aa  49.7  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 		 393 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  24.5 
 
 		 459 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.29 
 
 		 796 aa  49.7  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  30.63 
 
 		 248 aa  49.3  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.11 
 
 		 442 aa  48.9  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  28.66 
 
 		 686 aa  48.5  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 		 706 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 		 419 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.57 
 
 		 420 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2313  hypothetical protein  23.28 
 
 		 770 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 		 589 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  27.87 
 
 		 253 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  27.87 
 
 		 253 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  27.87 
 
 		 253 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  27.87 
 
 		 253 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  27.87 
 
 		 253 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  26.07 
 
 		 829 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 		 564 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 593 aa  47  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 625 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  26.54 
 
 		 340 aa  47  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 		 325 aa  47  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 412 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 		 642 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 592 aa  47  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  30.43 
 
 		 252 aa  47  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.3 
 
 		 621 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  25.49 
 
 		 639 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2058  von Willebrand factor, type A  30.07 
 
 		 349 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 		 412 aa  45.8  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  26.14 
 
 		 709 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 1188 aa  45.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  31.05 
 
 		 759 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  22.82 
 
 		 425 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  24.71 
 
 		 421 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 		 627 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  23.3 
 
 		 425 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  24.46 
 
 		 566 aa  45.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 		 282 aa  45.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.65 
 
 		 605 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 		 613 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  35.79 
 
 		 251 aa  44.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  28.57 
 
 		 250 aa  44.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 		 642 aa  44.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.36 
 
 		 751 aa  44.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 		 613 aa  44.3  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>