40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3739 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  81.35 
 
 
252 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  64.23 
 
 
247 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  64.08 
 
 
245 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  64.08 
 
 
245 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  64.08 
 
 
245 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  64.08 
 
 
245 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  63.67 
 
 
245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  46.15 
 
 
250 aa  248  9e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  44.53 
 
 
248 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  43.5 
 
 
249 aa  224  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  42.23 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  42.23 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  42.46 
 
 
257 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  41.43 
 
 
256 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  42.62 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  38.4 
 
 
251 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  34.66 
 
 
254 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  28.05 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  28.07 
 
 
759 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  33.68 
 
 
1023 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  30.14 
 
 
761 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  30.14 
 
 
761 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  28.28 
 
 
761 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  27.87 
 
 
932 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  25.79 
 
 
700 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
902 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 
903 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 
842 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  27.38 
 
 
951 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  28.75 
 
 
696 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
847 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  35.24 
 
 
851 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
958 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 
936 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  30.93 
 
 
828 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>