30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2614 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  30.36 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  31.56 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  27.03 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  29.2 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  29.2 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  28.05 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  28.05 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  28.05 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  28.05 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  28.05 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  28.38 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  26.34 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  28.95 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  28.8 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  25.77 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  24.75 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  29.19 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  26.25 
 
 
759 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  30.85 
 
 
761 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2313  hypothetical protein  25.35 
 
 
770 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 
903 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  29.85 
 
 
761 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  29.85 
 
 
761 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  31.03 
 
 
693 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>