31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6009 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  44.44 
 
 
251 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  44.31 
 
 
249 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  41.9 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  40.48 
 
 
256 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  41.37 
 
 
252 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  40.96 
 
 
254 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  40.96 
 
 
254 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  35.71 
 
 
250 aa  178  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  35.16 
 
 
248 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  35.2 
 
 
252 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  34.66 
 
 
253 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  34.66 
 
 
253 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  34.66 
 
 
253 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  34.66 
 
 
253 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  34.66 
 
 
253 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  32 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  29.6 
 
 
245 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  29.6 
 
 
245 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  29.6 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  29.6 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  29.6 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  25.77 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  30.29 
 
 
759 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 
950 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  30 
 
 
761 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  31.11 
 
 
761 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  34.12 
 
 
951 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  26.88 
 
 
1023 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  30 
 
 
761 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
914 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>