40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3691 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  73.05 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  72.33 
 
 		 256 aa  387  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  56.92 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  50.79 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  48.19 
 
 		 249 aa  244  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  44.08 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  44.08 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  44.08 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  44.08 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  44.08 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  42.23 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  42.23 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  42.23 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  42.23 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  42.23 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  43.72 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  42.86 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  40.24 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  41.13 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  40.96 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  29.2 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  30.7 
 
 		 761 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  30.7 
 
 		 761 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  31.43 
 
 		 761 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  32.95 
 
 		 918 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  38.04 
 
 		 950 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 		 978 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 		 902 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 958 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  28.37 
 
 		 759 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  32.61 
 
 		 851 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  28.72 
 
 		 951 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  37.8 
 
 		 903 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  31.33 
 
 		 1023 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  35.53 
 
 		 966 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  35.9 
 
 		 972 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 847 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 842 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>