38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1961 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  99.59 
 
 		 245 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  99.18 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  99.59 
 
 		 245 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  98.78 
 
 		 245 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  73.88 
 
 		 247 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  65.71 
 
 		 252 aa  343  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  64.08 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  64.08 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  64.08 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  64.08 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  64.08 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  48.57 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  46.67 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  44.08 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  44.08 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  44.17 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  41.46 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  41.46 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  38.78 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  39.43 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  29.6 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  30.77 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 		 902 aa  48.5  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  32.64 
 
 		 696 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  32.64 
 
 		 696 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  28.4 
 
 		 759 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  32.17 
 
 		 696 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  33.91 
 
 		 851 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  36.51 
 
 		 950 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  26.57 
 
 		 761 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 		 847 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  31.75 
 
 		 978 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  31.25 
 
 		 693 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  31.43 
 
 		 888 aa  42  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  26.09 
 
 		 761 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  26.09 
 
 		 761 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 		 932 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>