32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7478 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  87.11 
 
 		 257 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  72.33 
 
 		 254 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  72.33 
 
 		 254 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  55.69 
 
 		 252 aa  291  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  53.94 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  51.79 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  44.31 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  42.63 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  40.64 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  41.43 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  41.43 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  41.43 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  41.43 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  41.43 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  41.87 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  41.46 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  41.46 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  41.46 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  41.46 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  40.48 
 
 		 254 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  40.08 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  26.34 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  34.09 
 
 		 950 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  32.91 
 
 		 978 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 		 936 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  34.09 
 
 		 951 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  33.77 
 
 		 914 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  24.24 
 
 		 888 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  28.16 
 
 		 761 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  28.98 
 
 		 695 aa  43.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  26.55 
 
 		 761 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>