46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0772 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  517  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  65.32 
 
 
252 aa  344  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  54.12 
 
 
257 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  53.94 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  54.47 
 
 
249 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  50.79 
 
 
254 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  50.79 
 
 
254 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  42 
 
 
250 aa  215  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  44.44 
 
 
254 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  39.52 
 
 
248 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  40.08 
 
 
252 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  40.32 
 
 
247 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  38.4 
 
 
253 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  39.84 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  39.43 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  39.43 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  39.43 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  35.55 
 
 
761 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  35.55 
 
 
761 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  35.07 
 
 
761 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  38.38 
 
 
759 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  28.95 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  36.43 
 
 
950 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 
958 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  35.79 
 
 
918 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  37.61 
 
 
966 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  36.8 
 
 
972 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  34.44 
 
 
1023 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  41.43 
 
 
914 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 
851 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  46.48 
 
 
828 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  40 
 
 
936 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  30.3 
 
 
951 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  32.63 
 
 
978 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  34.69 
 
 
847 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  36.9 
 
 
932 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 
902 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 
888 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 
842 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
903 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  30.66 
 
 
695 aa  42.4  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>