51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3926 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  46.49 
 
 
950 aa  760    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  100 
 
 
978 aa  1957    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  41.06 
 
 
958 aa  614  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  37.57 
 
 
932 aa  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  38.2 
 
 
936 aa  531  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  36.02 
 
 
966 aa  528  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  36.76 
 
 
972 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  32.19 
 
 
918 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 
914 aa  399  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  30.36 
 
 
951 aa  399  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  26.43 
 
 
902 aa  298  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 
903 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  27.92 
 
 
1023 aa  275  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 
842 aa  259  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 
888 aa  249  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 
828 aa  244  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  28.41 
 
 
851 aa  241  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 
847 aa  241  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 
859 aa  199  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  23.06 
 
 
717 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 
744 aa  68.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  24.33 
 
 
813 aa  67.4  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
788 aa  67  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1935  hypothetical protein  22.17 
 
 
828 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.115216  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
412 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  20.73 
 
 
459 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  34.52 
 
 
250 aa  55.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.22 
 
 
442 aa  55.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  26.18 
 
 
789 aa  53.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  25.77 
 
 
419 aa  52  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  32.65 
 
 
254 aa  51.6  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  51.6  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  29.17 
 
 
252 aa  51.6  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  29.59 
 
 
831 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
411 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  32.63 
 
 
251 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  37.35 
 
 
249 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 
356 aa  47.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2058  von Willebrand factor, type A  25.91 
 
 
349 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  30.99 
 
 
248 aa  47  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 
561 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
1188 aa  45.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  26.21 
 
 
322 aa  45.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 
607 aa  45.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  25 
 
 
761 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2646  hypothetical protein  23.35 
 
 
877 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0657655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  25 
 
 
761 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  35.53 
 
 
257 aa  44.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  32.91 
 
 
256 aa  44.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  22.65 
 
 
412 aa  44.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>