36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2586 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  500  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  51.79 
 
 
256 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  54.47 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  52.38 
 
 
257 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  53.69 
 
 
252 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  48.19 
 
 
254 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  48.19 
 
 
254 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  45.34 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  43.5 
 
 
253 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  43.5 
 
 
253 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  43.5 
 
 
253 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  43.5 
 
 
253 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  43.5 
 
 
253 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  41.37 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  41.63 
 
 
252 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  44.31 
 
 
254 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  40.41 
 
 
247 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  38.78 
 
 
245 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  39.18 
 
 
245 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  38.78 
 
 
245 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  38.78 
 
 
245 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  38.78 
 
 
245 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  28.8 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  34.94 
 
 
950 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
972 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  41.67 
 
 
958 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
966 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  28.57 
 
 
696 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  37.35 
 
 
978 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  31.46 
 
 
761 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  31.46 
 
 
761 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  30.99 
 
 
761 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
902 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  30.14 
 
 
759 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
828 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 
918 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>