39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1478 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  99.18 
 
 
245 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  98.78 
 
 
245 aa  510  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  99.18 
 
 
245 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  98.78 
 
 
245 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  74.29 
 
 
247 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  66.12 
 
 
252 aa  345  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  63.67 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  63.67 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  63.67 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  63.67 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  63.67 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  48.57 
 
 
250 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  46.67 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  44.08 
 
 
254 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  44.08 
 
 
254 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  44.58 
 
 
252 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  41.87 
 
 
257 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  41.87 
 
 
256 aa  201  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  38.78 
 
 
249 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  29.6 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  30.77 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  32.1 
 
 
902 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  30.95 
 
 
696 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  30.95 
 
 
696 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  30.54 
 
 
696 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  28.48 
 
 
759 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 
950 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  33.61 
 
 
851 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 
847 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  26.6 
 
 
761 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 
932 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  31.75 
 
 
978 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  31.43 
 
 
888 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  31.25 
 
 
693 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 
842 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  26.11 
 
 
761 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  26.11 
 
 
761 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>