36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1083 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  81.35 
 
 		 253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  81.35 
 
 		 253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  81.35 
 
 		 253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  81.35 
 
 		 253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  81.35 
 
 		 253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  66.12 
 
 		 245 aa  345  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  65.71 
 
 		 245 aa  344  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  65.71 
 
 		 245 aa  344  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  65.71 
 
 		 245 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  65.71 
 
 		 245 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  63.27 
 
 		 247 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  47.35 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  45.93 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  43.72 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  44.72 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  43.72 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  44.31 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  41.63 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  45.23 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  40.08 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  35.2 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  27.03 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  34.44 
 
 		 1023 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  26.37 
 
 		 759 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  34.86 
 
 		 761 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  34.86 
 
 		 761 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 		 932 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  34.86 
 
 		 761 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  29.03 
 
 		 687 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  30.22 
 
 		 688 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  29.03 
 
 		 724 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 958 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  33.73 
 
 		 950 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 		 902 aa  43.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  28.79 
 
 		 687 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>