29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3636 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  73.88 
 
 
245 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  74.29 
 
 
245 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  74.29 
 
 
245 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  74.29 
 
 
245 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  74.29 
 
 
245 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  64.23 
 
 
253 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  64.23 
 
 
253 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  64.23 
 
 
253 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  64.23 
 
 
253 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  64.23 
 
 
253 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  63.27 
 
 
252 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  47.37 
 
 
248 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  43.67 
 
 
250 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  40.24 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  40.24 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  41.91 
 
 
252 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  40.41 
 
 
249 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  39.53 
 
 
257 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  40.08 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  40.32 
 
 
251 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  32 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  31.56 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  30.46 
 
 
759 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  27.27 
 
 
761 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  27.27 
 
 
761 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  27.27 
 
 
761 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 
902 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  33.03 
 
 
851 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>