33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6165 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6165  protein of unknown function DUF1355  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7478  hypothetical protein  87.11 
 
 
256 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  73.05 
 
 
254 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  73.05 
 
 
254 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  56.47 
 
 
252 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  54.12 
 
 
251 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2586  hypothetical protein  52.38 
 
 
249 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  44.72 
 
 
252 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3624  protein of unknown function DUF1355  43.65 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00586741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2119  protein of unknown function DUF1355  42.46 
 
 
250 aa  210  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  42.46 
 
 
253 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  42.46 
 
 
253 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  42.46 
 
 
253 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  42.46 
 
 
253 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  42.46 
 
 
253 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  41.87 
 
 
245 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  41.46 
 
 
245 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  41.46 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  41.46 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  41.46 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6009  protein of unknown function DUF1355  41.9 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3636  hypothetical protein  39.53 
 
 
247 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.876703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2614  protein of unknown function DUF1355  30.36 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  32.95 
 
 
950 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  28.31 
 
 
688 aa  45.4  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
966 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  35.53 
 
 
978 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  33.77 
 
 
914 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
936 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 
888 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  32 
 
 
903 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  32.61 
 
 
761 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  37.25 
 
 
902 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>