44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4003 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  100 
 
 
1023 aa  2073    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  30.66 
 
 
951 aa  350  9e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  28.29 
 
 
966 aa  320  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 
958 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  29.8 
 
 
936 aa  299  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 
950 aa  293  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 
972 aa  293  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
918 aa  288  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  28.94 
 
 
932 aa  280  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
978 aa  273  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 
914 aa  254  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 
888 aa  244  5e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  25.11 
 
 
902 aa  240  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 
828 aa  235  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 
847 aa  233  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  26.64 
 
 
851 aa  228  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  25.52 
 
 
903 aa  191  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 
842 aa  187  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 
859 aa  176  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  24.76 
 
 
744 aa  95.1  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  24.95 
 
 
717 aa  77.8  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  23.33 
 
 
788 aa  63.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  26.37 
 
 
761 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  26.37 
 
 
761 aa  61.6  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  26.37 
 
 
761 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  25.6 
 
 
759 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  33.68 
 
 
253 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  33.68 
 
 
253 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  33.68 
 
 
253 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  33.68 
 
 
253 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  34.44 
 
 
251 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  33.68 
 
 
253 aa  51.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  22.55 
 
 
813 aa  49.7  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  34.44 
 
 
252 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1478  hypothetical protein  29.63 
 
 
245 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.147356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1790  hypothetical protein  29.63 
 
 
245 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1494  hypothetical protein  29.63 
 
 
245 aa  48.5  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00000000000000749394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1515  hypothetical protein  29.63 
 
 
245 aa  48.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  hitchhiker  0.0000000353352 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1961  hypothetical protein  29.63 
 
 
245 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000998327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1476  hypothetical protein  34.21 
 
 
252 aa  46.6  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  22.95 
 
 
699 aa  45.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3426  hypothetical protein  33.86 
 
 
254 aa  45.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3691  putative cytoplasmic protein  33.86 
 
 
254 aa  45.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  24.34 
 
 
696 aa  44.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>