48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2270 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  54.43 
 
 		 687 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  57.1 
 
 		 696 aa  735    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  56.55 
 
 		 693 aa  709    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  55.83 
 
 		 692 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  69.56 
 
 		 731 aa  960    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  57.82 
 
 		 696 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  53.41 
 
 		 687 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  57.23 
 
 		 688 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  54.36 
 
 		 687 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  52.98 
 
 		 687 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  100 
 
 		 699 aa  1380    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  53.85 
 
 		 687 aa  715    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  57.1 
 
 		 696 aa  734    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  57.02 
 
 		 692 aa  715    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  54.48 
 
 		 687 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  54.28 
 
 		 687 aa  707    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  48.34 
 
 		 689 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  48.49 
 
 		 689 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  47.98 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  47.26 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  48.41 
 
 		 691 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  47.98 
 
 		 689 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  47.76 
 
 		 689 aa  608  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  48.59 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  49.3 
 
 		 689 aa  591  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  46.23 
 
 		 694 aa  541  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  46.39 
 
 		 687 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  47.22 
 
 		 688 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  47.76 
 
 		 724 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  43.31 
 
 		 696 aa  531  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  45.56 
 
 		 688 aa  524  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  40.12 
 
 		 695 aa  509  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  43.54 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  47.79 
 
 		 700 aa  508  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  42.45 
 
 		 690 aa  475  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  42.25 
 
 		 715 aa  445  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  35.79 
 
 		 670 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  32.92 
 
 		 761 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  32.92 
 
 		 761 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  32.92 
 
 		 761 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  30.68 
 
 		 759 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  26.32 
 
 		 838 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  24.27 
 
 		 829 aa  71.2  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  22.38 
 
 		 732 aa  67.4  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  25.86 
 
 		 796 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  23.8 
 
 		 705 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  21.88 
 
 		 690 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  23.08 
 
 		 690 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>