53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3010 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  100 
 
 
715 aa  1389    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  44.92 
 
 
691 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  44.48 
 
 
696 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  44.33 
 
 
696 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  42.64 
 
 
687 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  42.64 
 
 
687 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  44.68 
 
 
690 aa  488  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  42.92 
 
 
692 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  42.5 
 
 
687 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  44.18 
 
 
688 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  41.8 
 
 
687 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  42.25 
 
 
699 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  43.75 
 
 
696 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  42.8 
 
 
692 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  41.21 
 
 
687 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  43.9 
 
 
694 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  42.22 
 
 
687 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  41.94 
 
 
687 aa  465  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  42.15 
 
 
693 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  44.3 
 
 
688 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  41.02 
 
 
696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  40.28 
 
 
689 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  39.92 
 
 
691 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  41.21 
 
 
691 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  43 
 
 
680 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  41.21 
 
 
689 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  38.9 
 
 
731 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  42.56 
 
 
724 aa  439  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  42.35 
 
 
690 aa  439  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  43.29 
 
 
687 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  40.42 
 
 
689 aa  439  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  40.88 
 
 
688 aa  428  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  40.44 
 
 
689 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  40.36 
 
 
689 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  34.79 
 
 
695 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  42.14 
 
 
700 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  42.31 
 
 
670 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  32.66 
 
 
761 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  31.98 
 
 
761 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  31.76 
 
 
761 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  30.99 
 
 
759 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  28.14 
 
 
838 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  30.91 
 
 
796 aa  94.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  24.73 
 
 
829 aa  87  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 
932 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  23.81 
 
 
732 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1083  hypothetical protein  28.89 
 
 
252 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.842688  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 
936 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3919  hypothetical protein  25.97 
 
 
253 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.968045  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3750  hypothetical protein  25.97 
 
 
253 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3739  hypothetical protein  25.97 
 
 
253 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3860  hypothetical protein  25.97 
 
 
253 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3817  hypothetical protein  25.97 
 
 
253 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>