51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1559 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  53.28 
 
 		 687 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  53.11 
 
 		 687 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  49.35 
 
 		 695 aa  658    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  99.57 
 
 		 689 aa  1315    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  60.49 
 
 		 689 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  90.59 
 
 		 691 aa  1207    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  50.94 
 
 		 691 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  66.15 
 
 		 690 aa  835    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  51.67 
 
 		 688 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  53.64 
 
 		 687 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  52.25 
 
 		 687 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  53.18 
 
 		 687 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  54.09 
 
 		 687 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  59.45 
 
 		 689 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  61.36 
 
 		 689 aa  794    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  59.19 
 
 		 689 aa  813    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1393    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  51.72 
 
 		 687 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  49.56 
 
 		 696 aa  628  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  49.41 
 
 		 696 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  49.41 
 
 		 696 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  48.77 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  46.89 
 
 		 731 aa  614  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  49.71 
 
 		 692 aa  612  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  47.98 
 
 		 693 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  48.27 
 
 		 692 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  43.29 
 
 		 696 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  44.08 
 
 		 694 aa  535  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  45.58 
 
 		 688 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  43.14 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  44.1 
 
 		 687 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  44.98 
 
 		 724 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  42.99 
 
 		 680 aa  502  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  42.03 
 
 		 690 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  42.31 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  41.97 
 
 		 715 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  40.49 
 
 		 670 aa  319  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  27.79 
 
 		 761 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  27.21 
 
 		 761 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  27.06 
 
 		 761 aa  140  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  25.84 
 
 		 759 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  25.71 
 
 		 838 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  24.12 
 
 		 732 aa  78.2  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  22.33 
 
 		 829 aa  71.2  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  25.65 
 
 		 951 aa  55.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  26.19 
 
 		 705 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  23.08 
 
 		 796 aa  53.9  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 		 842 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  21.4 
 
 		 677 aa  50.8  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  21.71 
 
 		 690 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 918 aa  49.3  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>