22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08231 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  100 
 
 
677 aa  1368    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2888  hypothetical protein  41.45 
 
 
675 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00132631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  26.12 
 
 
690 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  26.44 
 
 
695 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  25.79 
 
 
705 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  25.36 
 
 
690 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  22.14 
 
 
712 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  20 
 
 
759 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  22.12 
 
 
838 aa  57.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  21.27 
 
 
761 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  21.27 
 
 
761 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  22.22 
 
 
688 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  22.86 
 
 
796 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  20.52 
 
 
761 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  22.93 
 
 
687 aa  50.8  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  22.18 
 
 
687 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  22.26 
 
 
687 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  21.56 
 
 
696 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  21.56 
 
 
696 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 
902 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  21.25 
 
 
691 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  21.13 
 
 
687 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>