25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2587 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  49.72 
 
 		 705 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  100 
 
 		 690 aa  1409    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  37.08 
 
 		 690 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  29.43 
 
 		 695 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  26.16 
 
 		 677 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2888  hypothetical protein  24.31 
 
 		 675 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00132631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  26.4 
 
 		 712 aa  167  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  25.37 
 
 		 838 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  22.08 
 
 		 761 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  22.36 
 
 		 759 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  21.92 
 
 		 761 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  21.75 
 
 		 761 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  20.67 
 
 		 796 aa  68.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  26.06 
 
 		 692 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  24.27 
 
 		 878 aa  61.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  24.9 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  23.89 
 
 		 696 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  24.37 
 
 		 693 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  23.89 
 
 		 696 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  23.35 
 
 		 696 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  22.63 
 
 		 689 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  21.24 
 
 		 687 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  22.35 
 
 		 689 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  21.72 
 
 		 670 aa  44.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  22.22 
 
 		 689 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>