29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1804 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  100 
 
 		 878 aa  1773    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.59 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  23.52 
 
 		 732 aa  133  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  22.6 
 
 		 829 aa  124  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  23.61 
 
 		 761 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  23.68 
 
 		 761 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  23.68 
 
 		 761 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  22.28 
 
 		 705 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  23.22 
 
 		 838 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  23.26 
 
 		 759 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  24.27 
 
 		 690 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  21.35 
 
 		 690 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  23.56 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  24.14 
 
 		 692 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  24.65 
 
 		 690 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  26.79 
 
 		 693 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  23.83 
 
 		 692 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  25.62 
 
 		 687 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  25.27 
 
 		 966 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  25.71 
 
 		 696 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 903 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  26.37 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  25.71 
 
 		 696 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  25.71 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 		 972 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  26.5 
 
 		 687 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  22.11 
 
 		 958 aa  45.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  24.04 
 
 		 687 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  24.7 
 
 		 687 aa  44.3  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>