46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2770 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  60.61 
 
 		 694 aa  787    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  58.75 
 
 		 724 aa  721    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  59.08 
 
 		 688 aa  753    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  59.45 
 
 		 687 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  59.22 
 
 		 688 aa  769    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1332    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  53.6 
 
 		 700 aa  634  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  47.62 
 
 		 691 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  46.51 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  46.51 
 
 		 696 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  46.36 
 
 		 696 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  44.22 
 
 		 687 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  44.83 
 
 		 689 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  44.08 
 
 		 688 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  46.52 
 
 		 689 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  45.3 
 
 		 692 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  45.17 
 
 		 690 aa  525  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  44.22 
 
 		 687 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  44.01 
 
 		 687 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  44.14 
 
 		 687 aa  525  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  43.29 
 
 		 687 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  43.31 
 
 		 699 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  45.6 
 
 		 692 aa  522  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  43 
 
 		 687 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  44.83 
 
 		 693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  46.94 
 
 		 690 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  43.29 
 
 		 687 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  46.68 
 
 		 689 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  41.76 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  41.88 
 
 		 689 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  42.07 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  44.03 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  42.73 
 
 		 696 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  41.37 
 
 		 731 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  39.39 
 
 		 695 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  43.24 
 
 		 715 aa  432  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  37.78 
 
 		 670 aa  297  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  29.93 
 
 		 761 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  29.93 
 
 		 761 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  29.93 
 
 		 761 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  25.71 
 
 		 838 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  26.26 
 
 		 759 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  21.11 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.55 
 
 		 796 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  22.59 
 
 		 690 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  30.99 
 
 		 829 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>