48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0372 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  100 
 
 		 690 aa  1330    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  46.55 
 
 		 691 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  47.64 
 
 		 694 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  45.02 
 
 		 688 aa  524  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  46.76 
 
 		 688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  46.55 
 
 		 687 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  43.8 
 
 		 687 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  44.24 
 
 		 687 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  46.94 
 
 		 680 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  44.16 
 
 		 688 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  44.24 
 
 		 687 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  43.9 
 
 		 696 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  43.66 
 
 		 687 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  43.66 
 
 		 687 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  46.79 
 
 		 724 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  43.25 
 
 		 731 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  44.32 
 
 		 687 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  41.89 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  43.52 
 
 		 687 aa  485  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  41.24 
 
 		 689 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  42.45 
 
 		 699 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  41.09 
 
 		 691 aa  482  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  42.88 
 
 		 696 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  42.73 
 
 		 696 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  42.35 
 
 		 689 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  42.58 
 
 		 696 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  43.32 
 
 		 690 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  44.44 
 
 		 692 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  44.68 
 
 		 715 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  43.29 
 
 		 692 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  39.25 
 
 		 689 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  38.82 
 
 		 689 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  42.35 
 
 		 693 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  44.27 
 
 		 700 aa  445  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  40.55 
 
 		 689 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  38.07 
 
 		 695 aa  398  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  38.62 
 
 		 670 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  32.07 
 
 		 761 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  32.07 
 
 		 761 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  31.9 
 
 		 761 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  32.31 
 
 		 759 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  33.22 
 
 		 838 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  25.29 
 
 		 732 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  23.26 
 
 		 829 aa  61.6  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  25.61 
 
 		 796 aa  57.4  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 		 918 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  28.49 
 
 		 717 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 902 aa  44.3  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>