47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2903 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  65.49 
 
 		 724 aa  788    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2903  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1352    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.177101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  65.61 
 
 		 688 aa  812    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  62.21 
 
 		 688 aa  811    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  66.37 
 
 		 687 aa  824    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2770  hypothetical protein  62.3 
 
 		 680 aa  759    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3905  hypothetical protein  53.22 
 
 		 700 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  48.2 
 
 		 691 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  47.19 
 
 		 688 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  45.98 
 
 		 687 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  45.19 
 
 		 689 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  46.97 
 
 		 690 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  46.74 
 
 		 687 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  44.62 
 
 		 689 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  44.8 
 
 		 687 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  46.32 
 
 		 687 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  46.68 
 
 		 687 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  46.62 
 
 		 687 aa  538  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  45.51 
 
 		 699 aa  537  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  45.41 
 
 		 696 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  44.29 
 
 		 731 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  46.12 
 
 		 693 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  45.41 
 
 		 696 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  46.64 
 
 		 689 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  45.11 
 
 		 687 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  45.41 
 
 		 696 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  44.51 
 
 		 696 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0372  hypothetical protein  47.64 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  44.02 
 
 		 689 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  43.87 
 
 		 691 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1606  hypothetical protein  44.21 
 
 		 691 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  45.73 
 
 		 692 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  46.73 
 
 		 689 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  45.89 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  37.72 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3010  hypothetical protein  44.23 
 
 		 715 aa  445  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  37.86 
 
 		 670 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  35.62 
 
 		 761 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  35.62 
 
 		 761 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  34.54 
 
 		 761 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  31 
 
 		 759 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  27.6 
 
 		 838 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  24.28 
 
 		 732 aa  68.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.47 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1416  protein of unknown function DUF1355  24.87 
 
 		 829 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.737911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2313  hypothetical protein  23.53 
 
 		 770 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  23.48 
 
 		 951 aa  48.5  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>