184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1251 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  100 
 
 
322 aa  642    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  25.86 
 
 
320 aa  95.9  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.69 
 
 
344 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  27.1 
 
 
651 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  23.61 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  26.91 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.23 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  25.67 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  25.09 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  23.68 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.69 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.43 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  24.32 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 
611 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  24.02 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  27.4 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  26.44 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  26.67 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  25.1 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  25.44 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.16 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  24.04 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.4 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  28.3 
 
 
601 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  25.65 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  24.12 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  22.94 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  23.56 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  23.81 
 
 
349 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  27.85 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0172  von Willebrand factor type A domain protein  26.36 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.141772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  22.66 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  26.22 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  29 
 
 
599 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  20.96 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  25.36 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  23.53 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  26.27 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  22.84 
 
 
345 aa  62.4  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
754 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  22.99 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  24.56 
 
 
595 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  21.98 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  21.98 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.36 
 
 
329 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
587 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  25.69 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  23.51 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  22.91 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  21.49 
 
 
336 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  21.61 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.98 
 
 
338 aa  59.3  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  24.69 
 
 
619 aa  59.3  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  21.59 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  25.12 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  25.53 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  26.63 
 
 
658 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  20.88 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  21.25 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  27.68 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
612 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  22.94 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  24.64 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  23.04 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  26.67 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  20.88 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  21.99 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 
330 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  22.57 
 
 
334 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  24.75 
 
 
646 aa  55.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.04 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  25.93 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  23.04 
 
 
358 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  20.88 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  26.43 
 
 
471 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  24.78 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  24.77 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  28.22 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  22.82 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
647 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  24.14 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  22.82 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  22.82 
 
 
335 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  25.71 
 
 
307 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
533 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>