93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2383 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  100 
 
 
831 aa  1654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  49.28 
 
 
774 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  56.67 
 
 
795 aa  621  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  49.25 
 
 
796 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  58.3 
 
 
1033 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 
819 aa  300  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.91 
 
 
794 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.67 
 
 
791 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  32.12 
 
 
750 aa  273  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  34.43 
 
 
761 aa  268  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.79 
 
 
738 aa  268  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.47 
 
 
732 aa  263  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.86 
 
 
723 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.48 
 
 
755 aa  258  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.48 
 
 
712 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  31.3 
 
 
755 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.48 
 
 
740 aa  246  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.98 
 
 
725 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.96 
 
 
1362 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.46 
 
 
755 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.36 
 
 
751 aa  231  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.73 
 
 
759 aa  228  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  28.25 
 
 
757 aa  227  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30 
 
 
812 aa  222  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.9 
 
 
760 aa  219  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.27 
 
 
772 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  30.46 
 
 
711 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  27.75 
 
 
776 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  26.8 
 
 
771 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.88 
 
 
771 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.66 
 
 
763 aa  212  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.95 
 
 
772 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.54 
 
 
729 aa  210  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  26.65 
 
 
701 aa  210  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  26.18 
 
 
789 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.48 
 
 
786 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.16 
 
 
691 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.69 
 
 
770 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.05 
 
 
671 aa  196  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.06 
 
 
701 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.82 
 
 
722 aa  188  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  26.29 
 
 
739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.48 
 
 
776 aa  180  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.36 
 
 
753 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  28.66 
 
 
833 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  28.94 
 
 
840 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  24.5 
 
 
775 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.38 
 
 
680 aa  112  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  23.43 
 
 
1109 aa  91.7  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  26.46 
 
 
713 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.87 
 
 
338 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  34.04 
 
 
421 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
903 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 
418 aa  58.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 
412 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 
978 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  30.38 
 
 
412 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.26 
 
 
412 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 
462 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  28.17 
 
 
419 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 
1188 aa  55.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
418 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.36 
 
 
418 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
393 aa  53.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 
902 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
420 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 
412 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 
412 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  27.5 
 
 
411 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 
847 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  26.36 
 
 
1115 aa  52  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  30.32 
 
 
918 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  29.77 
 
 
523 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
425 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30 
 
 
459 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 
419 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  25 
 
 
582 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  29.14 
 
 
851 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
425 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  26.47 
 
 
1120 aa  47.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  28.68 
 
 
363 aa  47.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
415 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
1100 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.13 
 
 
479 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2213  von Willebrand factor, type A  21.6 
 
 
460 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 
418 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 
418 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.24 
 
 
418 aa  45.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.19 
 
 
963 aa  44.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 
842 aa  45.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0174  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
452 aa  44.3  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
419 aa  44.3  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 
828 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>