97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2492 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 		 770 aa  1587    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  46.99 
 
 		 789 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  56.41 
 
 		 739 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.17 
 
 		 755 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.96 
 
 		 751 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.18 
 
 		 759 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  46.98 
 
 		 760 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.74 
 
 		 772 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  49.22 
 
 		 757 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  50 
 
 		 771 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  50 
 
 		 772 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  48.74 
 
 		 771 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  45.82 
 
 		 722 aa  595  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  44.49 
 
 		 776 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  39.09 
 
 		 753 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.87 
 
 		 755 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  36.11 
 
 		 701 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  37.29 
 
 		 750 aa  412  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  38.4 
 
 		 794 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  37.33 
 
 		 791 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.98 
 
 		 740 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  35.08 
 
 		 763 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  35.9 
 
 		 755 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.1 
 
 		 732 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  34.62 
 
 		 761 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.76 
 
 		 738 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33 
 
 		 712 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.53 
 
 		 723 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.01 
 
 		 729 aa  340  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.22 
 
 		 786 aa  339  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.15 
 
 		 725 aa  334  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.68 
 
 		 819 aa  290  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.29 
 
 		 1362 aa  267  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.79 
 
 		 691 aa  254  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.23 
 
 		 812 aa  249  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.73 
 
 		 701 aa  247  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  27.42 
 
 		 711 aa  228  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  28.34 
 
 		 774 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.3 
 
 		 671 aa  204  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.27 
 
 		 795 aa  203  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.43 
 
 		 1033 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.8 
 
 		 831 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  26.52 
 
 		 776 aa  180  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.54 
 
 		 796 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 775 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  23.09 
 
 		 840 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  22.12 
 
 		 713 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  21.01 
 
 		 680 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  33.33 
 
 		 1109 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  30.16 
 
 		 833 aa  72  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.83 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.38 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 462 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  23.93 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  23.73 
 
 		 420 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.21 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.19 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 		 459 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.74 
 
 		 338 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  23.37 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 		 412 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  22.17 
 
 		 415 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  23.62 
 
 		 363 aa  55.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 393 aa  55.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  25.49 
 
 		 412 aa  55.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  23.13 
 
 		 423 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 		 561 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 828 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  32.17 
 
 		 523 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 425 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 		 562 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.94 
 
 		 425 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  25.77 
 
 		 550 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  24.78 
 
 		 430 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  24.19 
 
 		 842 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 		 546 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1807  hypothetical protein  30.16 
 
 		 382 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 		 412 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  23.44 
 
 		 547 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  24.73 
 
 		 571 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  26.74 
 
 		 582 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.18 
 
 		 588 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  24.27 
 
 		 380 aa  47.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.94 
 
 		 575 aa  46.2  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.43 
 
 		 412 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  23.2 
 
 		 479 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 		 575 aa  46.2  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  23.56 
 
 		 412 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 		 610 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  22.31 
 
 		 984 aa  44.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  23.96 
 
 		 543 aa  44.3  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 		 562 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>