184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3275 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  90.21 
 
 		 420 aa  778    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 419 aa  849    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  70.19 
 
 		 419 aa  597  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  58.89 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  45.5 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  41.52 
 
 		 412 aa  312  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  41.28 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  41.94 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  31.88 
 
 		 425 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  30.92 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  30.31 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.6 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  30.53 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.82 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  31.03 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 421 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  30.3 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 		 426 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  28.6 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  30.97 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  30.97 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.23 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 		 472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.9 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.55 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.77 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  31.7 
 
 		 411 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  28.27 
 
 		 452 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  31.12 
 
 		 452 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  25.19 
 
 		 615 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  25.94 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  26.99 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.52 
 
 		 776 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  29.56 
 
 		 761 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  32.93 
 
 		 842 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  27.48 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  31.4 
 
 		 143 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  24.1 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 		 847 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.09 
 
 		 755 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 902 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  27.94 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.6 
 
 		 732 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  30.54 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.64 
 
 		 851 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.84 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.46 
 
 		 738 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 888 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  28.4 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.76 
 
 		 760 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.46 
 
 		 771 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.83 
 
 		 755 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  28.74 
 
 		 563 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.34 
 
 		 725 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  23.4 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  26.78 
 
 		 701 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.28 
 
 		 751 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3066  von Willebrand factor type A  27.25 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000574906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.17 
 
 		 791 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.93 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 		 903 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  27.23 
 
 		 757 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  27.54 
 
 		 755 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.14 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  25 
 
 		 776 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 698 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  25.54 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.11 
 
 		 772 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  29.55 
 
 		 750 aa  63.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  24.86 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  27.75 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 		 775 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.7 
 
 		 759 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.49 
 
 		 1362 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  27.15 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  24.63 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  24.72 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  29.19 
 
 		 1188 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  24.77 
 
 		 771 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 		 1446 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>