113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1383 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 363 aa  741    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  44.92 
 
 		 383 aa  308  8e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  41.24 
 
 		 380 aa  293  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  32.23 
 
 		 356 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0335  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 		 847 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.44 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27.07 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 		 842 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  27.02 
 
 		 851 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.51 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  24.73 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 418 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25 
 
 		 472 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 		 903 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  28.75 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.28 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  21.53 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  24.14 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.87 
 
 		 755 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 		 888 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.86 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.34 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.72 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.3 
 
 		 759 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  24.8 
 
 		 750 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  23.56 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.35 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.28 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.83 
 
 		 755 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.14 
 
 		 751 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.62 
 
 		 770 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 		 775 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  22.32 
 
 		 602 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.35 
 
 		 738 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.75 
 
 		 791 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  23.5 
 
 		 828 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.43 
 
 		 794 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 1100 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  25.3 
 
 		 776 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  21.58 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.9 
 
 		 723 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 		 592 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.29 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  23.75 
 
 		 760 aa  49.7  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  24.34 
 
 		 701 aa  49.3  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 		 536 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 902 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  23.5 
 
 		 609 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  24.16 
 
 		 625 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  23.79 
 
 		 753 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  24.32 
 
 		 757 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 		 918 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  29.77 
 
 		 774 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.74 
 
 		 691 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.56 
 
 		 671 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  21.5 
 
 		 722 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.26 
 
 		 812 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  27.06 
 
 		 566 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  23.91 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  24.64 
 
 		 1109 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.04 
 
 		 712 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.2 
 
 		 701 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.13 
 
 		 795 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  26.11 
 
 		 711 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  23.6 
 
 		 624 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  25.28 
 
 		 613 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 		 579 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 1077 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  20.19 
 
 		 763 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3147  von Willebrand factor, type A  22.27 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.03337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  23.16 
 
 		 755 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 		 966 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 		 610 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  21.62 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  20.6 
 
 		 786 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  26.01 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  21.58 
 
 		 972 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  24.38 
 
 		 795 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>