42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0335 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0335  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 394 aa  799    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  34.14 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  30.83 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 		 363 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  34.29 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  22.25 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.09 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  24.72 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  26.38 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.41 
 
 		 412 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  28.28 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.44 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  24.88 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  22.01 
 
 		 625 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  22.18 
 
 		 629 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  22.64 
 
 		 640 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  23.79 
 
 		 536 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  23.27 
 
 		 613 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.18 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  23.15 
 
 		 903 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  26.58 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.21 
 
 		 755 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  24.43 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  26.61 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  22.95 
 
 		 555 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 		 888 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 654 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  21.62 
 
 		 571 aa  45.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 642 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 		 2166 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  25.9 
 
 		 610 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  23.69 
 
 		 551 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  22.32 
 
 		 958 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.29 
 
 		 751 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>