60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4213 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  100 
 
 
455 aa  916    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  34.82 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 
412 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.98 
 
 
418 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 
419 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  33.63 
 
 
452 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
421 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  33.84 
 
 
452 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  32.77 
 
 
412 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 
420 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  32.12 
 
 
415 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 
419 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.36 
 
 
418 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 
423 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  24.45 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 
467 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  23.96 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  22.1 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  24.13 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 
479 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  22.94 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 
418 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  23.63 
 
 
418 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 
412 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  22.47 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  23.28 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  22.28 
 
 
418 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  22.36 
 
 
615 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.82 
 
 
460 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 
472 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.82 
 
 
472 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  23.14 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  24.86 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  25.42 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.55 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  21.54 
 
 
426 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.44 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0335  von Willebrand factor, type A  22.25 
 
 
394 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  25.71 
 
 
430 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  23.38 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
356 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3147  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 
420 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.03337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 
459 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  24.57 
 
 
633 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.63 
 
 
671 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  27.15 
 
 
380 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 
847 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.81 
 
 
812 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 
500 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
717 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  27.45 
 
 
613 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  23.9 
 
 
593 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  23.3 
 
 
625 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  23.9 
 
 
598 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.81 
 
 
701 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  32.18 
 
 
1100 aa  43.1  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  24.8 
 
 
651 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>