182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4385 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 		 451 aa  905    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  58.84 
 
 		 460 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  58.84 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  58.6 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.74 
 
 		 442 aa  299  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  33.7 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.88 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  25.91 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  24.45 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  28.05 
 
 		 420 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25.51 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  34.65 
 
 		 615 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  31.06 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  24.4 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  30.81 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  31.73 
 
 		 459 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.07 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27.94 
 
 		 571 aa  110  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.83 
 
 		 592 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 706 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 		 639 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 		 610 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.27 
 
 		 621 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.18 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.99 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.72 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  29.91 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  32.29 
 
 		 640 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  27.38 
 
 		 698 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.88 
 
 		 412 aa  103  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  24.52 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.37 
 
 		 426 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 625 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 613 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  30.64 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 		 624 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  30.49 
 
 		 490 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  28.68 
 
 		 566 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  24 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 		 551 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  25.85 
 
 		 350 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  30.84 
 
 		 625 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  27.95 
 
 		 633 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  26.17 
 
 		 612 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 		 792 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 627 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 		 654 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 642 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  28.25 
 
 		 642 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  26.02 
 
 		 602 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  25.8 
 
 		 588 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 		 642 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 593 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  27.49 
 
 		 598 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  27.25 
 
 		 709 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  22.54 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  27.03 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.46 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.9 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  23.14 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  24.71 
 
 		 708 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  22.96 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 859 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  25.55 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  25.11 
 
 		 651 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  22.7 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  31.22 
 
 		 902 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  23.62 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 		 1100 aa  70.1  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  23.24 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 842 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 		 903 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  29.61 
 
 		 951 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  24.29 
 
 		 686 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25.36 
 
 		 808 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  23.77 
 
 		 629 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 		 888 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  26.5 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 		 1446 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  39.18 
 
 		 143 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.19 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  24.86 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>