143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0384 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 423 aa  835    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  43.46 
 
 		 505 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  30.2 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  32.81 
 
 		 615 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  29.26 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  32.43 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.34 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.36 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.36 
 
 		 472 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.07 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  27.25 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  26.3 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28 
 
 		 442 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.79 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  35.11 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  29.19 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  31.56 
 
 		 479 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 		 480 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.96 
 
 		 423 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  28.8 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  30.03 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  30.29 
 
 		 610 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.24 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  32.13 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  28.66 
 
 		 563 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.69 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.42 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  28.91 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  32.55 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.82 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 642 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 792 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  31.71 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.74 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 592 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  27.89 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  23.91 
 
 		 571 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  23.53 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  27.55 
 
 		 633 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  27.62 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 		 536 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.62 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  28.43 
 
 		 651 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  34.17 
 
 		 143 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.1 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 		 613 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 		 651 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.9 
 
 		 621 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.62 
 
 		 588 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  32.63 
 
 		 555 aa  69.7  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 		 625 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 		 613 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 698 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 		 654 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.84 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 706 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 		 686 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  29.13 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.71 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  29.31 
 
 		 888 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  30.81 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 546 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 		 859 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  24.74 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  26.11 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.37 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  27.19 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.06 
 
 		 701 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 		 625 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  23.59 
 
 		 612 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.42 
 
 		 755 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.66 
 
 		 691 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 		 775 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  29.3 
 
 		 547 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  29.45 
 
 		 643 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  30.82 
 
 		 543 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  25.62 
 
 		 555 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  27.39 
 
 		 713 aa  53.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  25.31 
 
 		 819 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 		 709 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  31.93 
 
 		 966 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>