144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3252 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  72.95 
 
 
621 aa  835    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  70.22 
 
 
624 aa  837    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  70.55 
 
 
625 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  61.21 
 
 
612 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  73.19 
 
 
613 aa  858    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  96.81 
 
 
642 aa  1242    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  76.51 
 
 
633 aa  866    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  97.77 
 
 
642 aa  1255    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  97.45 
 
 
642 aa  1251    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  64.85 
 
 
640 aa  704    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  100 
 
 
627 aa  1283    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  50.7 
 
 
563 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  53.97 
 
 
566 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  45.01 
 
 
571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  47.46 
 
 
625 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  48.29 
 
 
698 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  50.86 
 
 
708 aa  463  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  54.51 
 
 
536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  48.63 
 
 
706 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  49.68 
 
 
651 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.74 
 
 
588 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  49.25 
 
 
651 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  47.67 
 
 
592 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  46.46 
 
 
575 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  50 
 
 
639 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.46 
 
 
575 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  49.4 
 
 
613 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  47.75 
 
 
686 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  46.97 
 
 
598 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  46.67 
 
 
654 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  46.51 
 
 
555 aa  425  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  47.73 
 
 
792 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  46.97 
 
 
593 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  50 
 
 
709 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  48.53 
 
 
551 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  41.75 
 
 
629 aa  338  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  52.43 
 
 
350 aa  322  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  42.74 
 
 
588 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  40.97 
 
 
555 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 
610 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  43.12 
 
 
490 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  38.96 
 
 
500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  29.98 
 
 
859 aa  173  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
935 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  34.16 
 
 
615 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  33.98 
 
 
462 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  31.36 
 
 
416 aa  97.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  29.75 
 
 
419 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.09 
 
 
442 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  32.51 
 
 
425 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.94 
 
 
460 aa  90.5  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.7 
 
 
451 aa  90.1  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 
472 aa  90.1  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  32.02 
 
 
425 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.53 
 
 
472 aa  87.8  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  32.34 
 
 
479 aa  87.4  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
808 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  23.26 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  27.31 
 
 
602 aa  80.5  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  28.51 
 
 
459 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  28.42 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 
418 aa  72  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.12 
 
 
680 aa  67.8  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 
452 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 
505 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 
415 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  32.49 
 
 
480 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01615  hypothetical protein  44.3 
 
 
86 aa  65.1  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 
418 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 
383 aa  63.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 
427 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 
421 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 
393 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 
412 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.53 
 
 
412 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  25.26 
 
 
441 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  28 
 
 
589 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  25.23 
 
 
701 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  34.51 
 
 
744 aa  56.2  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.82 
 
 
3027 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
966 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
958 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 
421 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
419 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 
914 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 
380 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  21.08 
 
 
816 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  25.86 
 
 
936 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  22.15 
 
 
592 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>