113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1994 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  100 
 
 		 671 aa  1387    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  47.28 
 
 		 701 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  46.59 
 
 		 711 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  46.38 
 
 		 812 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  46.38 
 
 		 691 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  32.68 
 
 		 819 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.26 
 
 		 1362 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.28 
 
 		 755 aa  285  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.93 
 
 		 751 aa  280  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.88 
 
 		 755 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.07 
 
 		 772 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.65 
 
 		 772 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.79 
 
 		 759 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.77 
 
 		 771 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  30.71 
 
 		 771 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  31 
 
 		 757 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.7 
 
 		 740 aa  262  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.51 
 
 		 723 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  30.26 
 
 		 760 aa  259  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.33 
 
 		 791 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  32.07 
 
 		 750 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.61 
 
 		 794 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  30.68 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  31.32 
 
 		 761 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  28.21 
 
 		 789 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  29.35 
 
 		 739 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.5 
 
 		 712 aa  230  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.53 
 
 		 776 aa  230  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  29.32 
 
 		 701 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.46 
 
 		 770 aa  227  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.14 
 
 		 722 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.11 
 
 		 738 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.68 
 
 		 732 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.96 
 
 		 753 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  27.73 
 
 		 774 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.05 
 
 		 831 aa  210  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.93 
 
 		 786 aa  203  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.96 
 
 		 795 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  27.53 
 
 		 776 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  27.26 
 
 		 796 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.88 
 
 		 725 aa  191  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.93 
 
 		 729 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.28 
 
 		 680 aa  157  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.73 
 
 		 1033 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.27 
 
 		 763 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  23.41 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  25 
 
 		 1109 aa  127  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  24.1 
 
 		 775 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  24.47 
 
 		 840 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  23.18 
 
 		 833 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.11 
 
 		 338 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  32.35 
 
 		 717 aa  64.7  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.38 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  29.22 
 
 		 543 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 		 903 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  24.62 
 
 		 416 aa  55.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  32.85 
 
 		 547 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 566 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  26.02 
 
 		 563 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  25.39 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 		 423 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  25.85 
 
 		 350 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1120 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  23.5 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  22.55 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  23.78 
 
 		 412 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.23 
 
 		 419 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  23.21 
 
 		 412 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  25.16 
 
 		 546 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  23.74 
 
 		 698 aa  50.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 418 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  24.32 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  23.53 
 
 		 555 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  26.35 
 
 		 425 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.41 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 		 589 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  23.39 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  23.56 
 
 		 363 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 		 792 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 480 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 		 847 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 412 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.71 
 
 		 442 aa  47.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 		 383 aa  47.4  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  23.7 
 
 		 462 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  26.74 
 
 		 708 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  25.65 
 
 		 851 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  22.73 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  32.63 
 
 		 455 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 935 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>