146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2200 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  82.28 
 
 		 760 aa  1269    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 		 759 aa  1552    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  96.83 
 
 		 755 aa  1459    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  95.12 
 
 		 751 aa  1427    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  72.45 
 
 		 771 aa  1096    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  70.94 
 
 		 757 aa  1075    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  72.74 
 
 		 772 aa  1100    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.57 
 
 		 770 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  48.29 
 
 		 789 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  72.19 
 
 		 771 aa  1097    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  50.81 
 
 		 739 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  72.61 
 
 		 772 aa  1110    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.02 
 
 		 722 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  45.34 
 
 		 776 aa  558  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  40.2 
 
 		 753 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  39.88 
 
 		 791 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.63 
 
 		 740 aa  422  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.42 
 
 		 755 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.35 
 
 		 763 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  36.49 
 
 		 701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  38.91 
 
 		 755 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  39.09 
 
 		 794 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.89 
 
 		 712 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  38.03 
 
 		 750 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  37.26 
 
 		 761 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.23 
 
 		 723 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.5 
 
 		 732 aa  357  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  37.6 
 
 		 738 aa  352  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.43 
 
 		 786 aa  349  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.76 
 
 		 725 aa  347  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.91 
 
 		 729 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.1 
 
 		 1362 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.48 
 
 		 819 aa  300  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  32.13 
 
 		 711 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.87 
 
 		 701 aa  274  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.88 
 
 		 812 aa  266  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.03 
 
 		 691 aa  257  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.79 
 
 		 671 aa  248  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  29.43 
 
 		 831 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  27.9 
 
 		 774 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.55 
 
 		 796 aa  223  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  29.28 
 
 		 776 aa  215  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.06 
 
 		 1033 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.98 
 
 		 795 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  26.76 
 
 		 833 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 		 840 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  30.03 
 
 		 775 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  22.01 
 
 		 713 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  28.06 
 
 		 1109 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.15 
 
 		 680 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.31 
 
 		 338 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.37 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 		 418 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.74 
 
 		 418 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  32.1 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 		 592 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.79 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.09 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.82 
 
 		 420 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 589 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.12 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 571 aa  62.4  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  26.14 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  26.19 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 		 427 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  22.89 
 
 		 462 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.4 
 
 		 419 aa  60.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  33.81 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  32.08 
 
 		 717 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.44 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  24.88 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  24.9 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.51 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 		 575 aa  57  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  28.3 
 
 		 363 aa  57.4  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.48 
 
 		 575 aa  57  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  26.14 
 
 		 847 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 547 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 		 421 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 		 744 aa  55.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.32 
 
 		 629 aa  55.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 		 610 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  30.37 
 
 		 570 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 		 698 aa  55.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  31.16 
 
 		 942 aa  54.3  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  24.31 
 
 		 550 aa  54.3  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  31.06 
 
 		 903 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26.71 
 
 		 643 aa  53.9  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  25.2 
 
 		 851 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>