128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1829 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  70.67 
 
 
760 aa  1089    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  73.9 
 
 
759 aa  1110    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  74.5 
 
 
755 aa  1114    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  74.9 
 
 
751 aa  1114    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  97.54 
 
 
771 aa  1469    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  74.74 
 
 
757 aa  1153    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 
772 aa  1566    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  49.31 
 
 
770 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  97.15 
 
 
771 aa  1468    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  52.99 
 
 
739 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  98.32 
 
 
772 aa  1540    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  47.42 
 
 
789 aa  634  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.84 
 
 
722 aa  621  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  44.36 
 
 
776 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  40.18 
 
 
755 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  38.64 
 
 
763 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  39.66 
 
 
753 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  38.83 
 
 
791 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.36 
 
 
740 aa  419  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  37.28 
 
 
750 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  37.73 
 
 
761 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  37.12 
 
 
794 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  37.7 
 
 
701 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  39.04 
 
 
755 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.52 
 
 
712 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.87 
 
 
723 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.71 
 
 
732 aa  372  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.5 
 
 
738 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.46 
 
 
725 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.91 
 
 
729 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.36 
 
 
786 aa  334  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.27 
 
 
1362 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  32.74 
 
 
711 aa  294  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.62 
 
 
819 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.49 
 
 
812 aa  266  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.48 
 
 
701 aa  260  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.8 
 
 
671 aa  259  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.08 
 
 
691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  28.85 
 
 
774 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.17 
 
 
796 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.1 
 
 
1033 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.08 
 
 
795 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  27.12 
 
 
831 aa  209  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  28.06 
 
 
776 aa  203  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 
833 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  25.08 
 
 
840 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 
775 aa  134  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  22.15 
 
 
713 aa  114  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.15 
 
 
680 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  34.04 
 
 
1109 aa  74.3  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 
418 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  33.14 
 
 
393 aa  72  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.91 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  32.14 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.89 
 
 
420 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 
425 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.18 
 
 
418 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 
418 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 
418 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.89 
 
 
418 aa  64.7  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.11 
 
 
419 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 
546 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 
426 aa  60.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  22.17 
 
 
423 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
592 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 
412 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.55 
 
 
419 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 
847 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
610 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
480 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  23.38 
 
 
412 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  25.46 
 
 
571 aa  57.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
589 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
430 aa  57.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.85 
 
 
416 aa  57.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3001  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 
365 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  26.55 
 
 
851 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.27 
 
 
459 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.63 
 
 
421 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
550 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.46 
 
 
427 aa  54.7  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
547 aa  54.3  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.81 
 
 
561 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  31.82 
 
 
523 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  29.7 
 
 
570 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  29.75 
 
 
744 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.57 
 
 
451 aa  51.6  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 
462 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.49 
 
 
442 aa  50.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 
562 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  24.7 
 
 
629 aa  50.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.52 
 
 
588 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 
717 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  24.04 
 
 
575 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3147  von Willebrand factor, type A  26.72 
 
 
420 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.03337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.04 
 
 
575 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
640 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  24.84 
 
 
643 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>