116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2742 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  64.77 
 
 
796 aa  850    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  100 
 
 
774 aa  1506    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  65.75 
 
 
795 aa  731    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  61.14 
 
 
1033 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  32.06 
 
 
819 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.55 
 
 
794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.7 
 
 
791 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.09 
 
 
812 aa  261  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.36 
 
 
712 aa  261  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.06 
 
 
723 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  34.51 
 
 
761 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.34 
 
 
738 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  31.87 
 
 
750 aa  253  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.88 
 
 
1362 aa  251  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  33.33 
 
 
711 aa  250  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.95 
 
 
755 aa  250  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.06 
 
 
740 aa  247  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.85 
 
 
732 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.38 
 
 
771 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.14 
 
 
772 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  29.07 
 
 
771 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.95 
 
 
760 aa  242  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  33.86 
 
 
755 aa  240  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  29.6 
 
 
757 aa  240  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.85 
 
 
772 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.85 
 
 
725 aa  237  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  27.42 
 
 
789 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.96 
 
 
755 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.98 
 
 
751 aa  231  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.69 
 
 
691 aa  230  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.06 
 
 
701 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.68 
 
 
763 aa  228  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.2 
 
 
759 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  28.84 
 
 
776 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.49 
 
 
770 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.3 
 
 
729 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.82 
 
 
786 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  28.28 
 
 
739 aa  211  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.02 
 
 
701 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.55 
 
 
722 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.64 
 
 
776 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.73 
 
 
671 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.57 
 
 
753 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  31.54 
 
 
840 aa  151  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
833 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.06 
 
 
680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 
775 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  24.5 
 
 
1109 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  24.32 
 
 
713 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.26 
 
 
338 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 
1188 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 
902 aa  65.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  30.66 
 
 
582 aa  64.7  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 
412 aa  62  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  32.92 
 
 
903 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
419 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.85 
 
 
851 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.93 
 
 
412 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 
1446 aa  58.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
459 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  33.9 
 
 
523 aa  57.4  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.61 
 
 
462 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.23 
 
 
418 aa  57  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30 
 
 
847 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 
474 aa  57  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49216  predicted protein  28.86 
 
 
694 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  32.16 
 
 
828 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 
430 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 
421 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  31.9 
 
 
1115 aa  56.6  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  30.63 
 
 
393 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  28.22 
 
 
420 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 
432 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  29.22 
 
 
479 aa  55.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.29 
 
 
984 aa  55.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.79 
 
 
418 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 
418 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  30.12 
 
 
418 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  32 
 
 
942 aa  55.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
427 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  29.77 
 
 
363 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 
442 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.35 
 
 
412 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
419 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  18.07 
 
 
959 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  30 
 
 
411 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 
415 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  34.32 
 
 
412 aa  50.8  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  32.7 
 
 
476 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
423 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 
412 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.14 
 
 
505 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 
425 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 
842 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 
425 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  27.69 
 
 
1120 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4946  von Willebrand factor type A  38.79 
 
 
431 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0264631  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 
319 aa  48.5  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
1077 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  26.16 
 
 
633 aa  47.8  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>