68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5407 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  100 
 
 
935 aa  1929    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  41.14 
 
 
625 aa  139  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  40.72 
 
 
639 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  42.94 
 
 
350 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  38.86 
 
 
536 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  41.14 
 
 
698 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  35.59 
 
 
613 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.31 
 
 
588 aa  127  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  40 
 
 
706 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  35 
 
 
575 aa  125  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35 
 
 
575 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  35.98 
 
 
566 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  39.43 
 
 
709 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  40.61 
 
 
640 aa  125  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  36.42 
 
 
629 aa  124  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  36.97 
 
 
625 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.03 
 
 
621 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  34.92 
 
 
563 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  34.46 
 
 
624 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  38.17 
 
 
613 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  38.86 
 
 
651 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  36.09 
 
 
792 aa  121  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  36.97 
 
 
633 aa  121  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  38.29 
 
 
651 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  34.25 
 
 
654 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 
555 aa  119  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
627 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  38.41 
 
 
551 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
642 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 
642 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  40.24 
 
 
588 aa  115  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  35.58 
 
 
686 aa  114  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  35.76 
 
 
642 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  34.94 
 
 
592 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  33.14 
 
 
571 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  35.67 
 
 
612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  32.57 
 
 
598 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 
593 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  35.23 
 
 
708 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  36.65 
 
 
555 aa  101  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  26.52 
 
 
490 aa  79  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 
610 aa  71.2  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 
500 aa  67  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.59 
 
 
418 aa  61.6  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.85 
 
 
701 aa  59.3  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  22.75 
 
 
691 aa  55.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  23.6 
 
 
711 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  24.2 
 
 
425 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.05 
 
 
812 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
859 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.82 
 
 
344 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.73 
 
 
418 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 
412 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  24.09 
 
 
412 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 
418 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 
418 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.78 
 
 
451 aa  48.5  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
412 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  26.28 
 
 
582 aa  48.9  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 
426 aa  48.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.44 
 
 
427 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 
421 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.63 
 
 
671 aa  46.2  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.23 
 
 
412 aa  45.8  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  22.09 
 
 
419 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  22.22 
 
 
808 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  24.84 
 
 
562 aa  44.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  25 
 
 
411 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>