130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1492 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
383 aa  777    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  62.11 
 
 
380 aa  502  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  44.92 
 
 
363 aa  320  3e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0335  von Willebrand factor, type A  34.62 
 
 
394 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 
356 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.6 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  22.39 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  24.24 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  22.14 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.31 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  21.88 
 
 
411 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
327 aa  67  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  32.3 
 
 
642 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
462 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  24.39 
 
 
425 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  23.9 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  24.36 
 
 
418 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.32 
 
 
420 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 
627 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 
642 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  30.21 
 
 
642 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  30.06 
 
 
625 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  26.35 
 
 
795 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 
393 aa  60.1  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.69 
 
 
460 aa  60.1  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 
430 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.69 
 
 
472 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 
1100 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.32 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  26.11 
 
 
563 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  29.45 
 
 
624 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  28.87 
 
 
612 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.74 
 
 
680 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  30.06 
 
 
613 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  30.67 
 
 
633 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  31.06 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.69 
 
 
472 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  23.26 
 
 
479 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  28.96 
 
 
717 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  30.18 
 
 
566 aa  57  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 
640 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.34 
 
 
621 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  27.39 
 
 
972 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  27.94 
 
 
582 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  23.11 
 
 
418 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  23.11 
 
 
418 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 
573 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.14 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  28.41 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  26.69 
 
 
750 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  23.38 
 
 
455 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  25.44 
 
 
1446 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
505 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
224 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  27.63 
 
 
543 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 
1215 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 
1215 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 
592 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 
1215 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 
903 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  25 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  28.66 
 
 
477 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  24.62 
 
 
477 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  25.26 
 
 
951 aa  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  32.74 
 
 
224 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
888 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 
514 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 
547 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 
244 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
775 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 
319 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
480 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
546 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
219 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  38.27 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  27.67 
 
 
490 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.69 
 
 
671 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3147  von Willebrand factor, type A  26.26 
 
 
420 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.03337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  24.26 
 
 
629 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  38.14 
 
 
212 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  38.14 
 
 
212 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  38.14 
 
 
212 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
315 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  25 
 
 
1188 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.07 
 
 
812 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2507  hypothetical protein  24.2 
 
 
834 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.669353  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>