83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4203 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  45.27 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  35.38 
 
 
236 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  29.13 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  27.19 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  35.03 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  31.05 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  31.05 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  31.05 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  34.92 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  32.98 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  30.66 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  28 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  29.19 
 
 
1204 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  29.52 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  32.32 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.93 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  31.75 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.32 
 
 
219 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  32.32 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  32.32 
 
 
219 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  32.32 
 
 
219 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  34.51 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  34.51 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.51 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  32.28 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  32 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  36.67 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  34.17 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  31.68 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  28.87 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  35.54 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  30.72 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  32.76 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  33.04 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  25.13 
 
 
346 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
346 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  25.65 
 
 
346 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  25.13 
 
 
346 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 
350 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  28.85 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  28.83 
 
 
224 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
211 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  27.62 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1319  hypothetical protein  27.96 
 
 
229 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.643261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  28.7 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 
352 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  26.14 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.23 
 
 
462 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  22.17 
 
 
343 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  25.63 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 
393 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 
380 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  29.7 
 
 
383 aa  49.3  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  25.52 
 
 
459 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 
430 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.54 
 
 
616 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  32.1 
 
 
546 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25 
 
 
442 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 
1077 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0446  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  31.67 
 
 
592 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  23.25 
 
 
334 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 
412 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  24.35 
 
 
744 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  28.99 
 
 
614 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 
418 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  33.33 
 
 
629 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  33.91 
 
 
713 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  22.61 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  22.78 
 
 
356 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 
903 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  31.3 
 
 
669 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.48 
 
 
674 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.42 
 
 
3027 aa  42.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0006  von Willebrand factor, type A  28.26 
 
 
592 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  27.66 
 
 
942 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  24 
 
 
320 aa  42  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>