56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0987 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  99.54 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  99.54 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  99.54 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  99.54 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  99.09 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  99.09 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  99.09 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  99.09 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  61.64 
 
 		 224 aa  287  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  60.91 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  60.91 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  66.2 
 
 		 254 aa  269  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  54.67 
 
 		 220 aa  234  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  54.21 
 
 		 224 aa  232  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  53.74 
 
 		 224 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  54.46 
 
 		 230 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  53.08 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  49.05 
 
 		 1204 aa  205  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  47.44 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  42.34 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  42.99 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  41.82 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  40.65 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  32.04 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  32.26 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  31.02 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  30.65 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  30.65 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  31.72 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  28.72 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  28.19 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  34.39 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  28.19 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  31.46 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  32.31 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  36.11 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  36.11 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  37.9 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  35.42 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  26.75 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  36.07 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  29.38 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1510  hypothetical protein  26.15 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.836921  normal  0.0611826 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  29.29 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  27.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  29.48 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>