57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0568 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  99.1 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  88.21 
 
 		 212 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  65.88 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  51.18 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  53.3 
 
 		 211 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  50.23 
 
 		 212 aa  205  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  50.79 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  50.69 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  48.15 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  48.15 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  48.15 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  48.15 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  40.38 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 		 346 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  35.75 
 
 		 346 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  35.75 
 
 		 346 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  35.75 
 
 		 346 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  36.36 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  37.97 
 
 		 352 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  35.03 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 		 1204 aa  85.1  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  30.62 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.81 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  29.35 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  36.11 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.11 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  30.57 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  36.11 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  36.11 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  35.42 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  35.42 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.42 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  35.42 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  29.1 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  26.18 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  25.77 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  29.01 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  32.06 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  29.83 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  26.97 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  28.88 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28 
 
 		 600 aa  41.6  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>