59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0567 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 346 aa  718    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  100 
 
 		 346 aa  718    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  100 
 
 		 346 aa  718    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  82.66 
 
 		 346 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  55.37 
 
 		 350 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  43.14 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  40.86 
 
 		 343 aa  265  5.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  42.63 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  41.45 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  40.53 
 
 		 212 aa  159  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  41.88 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  40 
 
 		 212 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  40 
 
 		 212 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  40 
 
 		 212 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  39.89 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  36.79 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  35.75 
 
 		 212 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  37.44 
 
 		 213 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  34.44 
 
 		 212 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  34.44 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  31.34 
 
 		 225 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  33.89 
 
 		 222 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  28.5 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  31.77 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  28.71 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  29 
 
 		 1204 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  28.72 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  33.12 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.66 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  28.66 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  28.66 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  28.66 
 
 		 219 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.66 
 
 		 219 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.03 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  28.03 
 
 		 219 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 		 224 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  27.32 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  26.34 
 
 		 220 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  27.8 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  28.17 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  27.19 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  31.67 
 
 		 248 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  24.45 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  27.92 
 
 		 202 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  26.22 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1319  hypothetical protein  26.04 
 
 		 229 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.643261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>