More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0636 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  100 
 
 		 616 aa  1165    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  62.77 
 
 		 657 aa  624  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  57.97 
 
 		 674 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.26 
 
 		 688 aa  586  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.3 
 
 		 674 aa  571  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  52.96 
 
 		 705 aa  568  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.06 
 
 		 673 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  54.03 
 
 		 719 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  55.54 
 
 		 680 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  52.22 
 
 		 637 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  44.55 
 
 		 680 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  52.64 
 
 		 699 aa  525  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.13 
 
 		 622 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.13 
 
 		 622 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.13 
 
 		 622 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  45.81 
 
 		 669 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  47.11 
 
 		 696 aa  505  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  50.47 
 
 		 626 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  52.76 
 
 		 618 aa  497  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  49.84 
 
 		 638 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.37 
 
 		 653 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  47.34 
 
 		 660 aa  475  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  49.31 
 
 		 629 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  47.29 
 
 		 670 aa  472  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  44.34 
 
 		 653 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  43.67 
 
 		 614 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  65.96 
 
 		 788 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.84 
 
 		 665 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.78 
 
 		 674 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  41.08 
 
 		 650 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  65.58 
 
 		 776 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  64.74 
 
 		 738 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  68.39 
 
 		 713 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  70.5 
 
 		 690 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  64.97 
 
 		 730 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  56.98 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  58.26 
 
 		 372 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  58.57 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  58.16 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.04 
 
 		 373 aa  358  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  55.06 
 
 		 347 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  57.63 
 
 		 362 aa  356  6.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.04 
 
 		 374 aa  356  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  56 
 
 		 351 aa  356  7.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50 
 
 		 337 aa  355  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.52 
 
 		 362 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.35 
 
 		 362 aa  350  5e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.35 
 
 		 362 aa  350  5e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.11 
 
 		 357 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.42 
 
 		 358 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.42 
 
 		 358 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.44 
 
 		 405 aa  350  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.45 
 
 		 362 aa  349  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  54.15 
 
 		 345 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  55.38 
 
 		 346 aa  347  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.27 
 
 		 369 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.65 
 
 		 362 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.65 
 
 		 362 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  48.78 
 
 		 356 aa  345  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.29 
 
 		 671 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.34 
 
 		 362 aa  343  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.65 
 
 		 362 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.14 
 
 		 364 aa  342  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  53.25 
 
 		 337 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  53.01 
 
 		 365 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.11 
 
 		 370 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.03 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.83 
 
 		 336 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  55.76 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.43 
 
 		 379 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.04 
 
 		 600 aa  333  8e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  50.78 
 
 		 637 aa  333  8e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  50.78 
 
 		 637 aa  332  1e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.8 
 
 		 337 aa  332  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.28 
 
 		 337 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.28 
 
 		 337 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  52.98 
 
 		 334 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.11 
 
 		 368 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  50.77 
 
 		 397 aa  327  5e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.66 
 
 		 340 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.66 
 
 		 340 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.46 
 
 		 394 aa  323  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.18 
 
 		 668 aa  321  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.04 
 
 		 340 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.31 
 
 		 383 aa  319  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.73 
 
 		 340 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.73 
 
 		 341 aa  317  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.19 
 
 		 672 aa  316  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.14 
 
 		 677 aa  315  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  52.66 
 
 		 334 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  52.66 
 
 		 334 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.57 
 
 		 348 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  52.66 
 
 		 334 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.14 
 
 		 383 aa  310  6.999999999999999e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.99 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.7 
 
 		 341 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  48.73 
 
 		 443 aa  306  7e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.68 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  52.55 
 
 		 689 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.76 
 
 		 386 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>