53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0630 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  709    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  43.71 
 
 
346 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  39.55 
 
 
350 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  40.86 
 
 
346 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  40.86 
 
 
346 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  40.86 
 
 
346 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  35.01 
 
 
352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  41.62 
 
 
212 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  39.31 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  40.24 
 
 
212 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  41.67 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  38.73 
 
 
212 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  38.73 
 
 
212 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  38.73 
 
 
212 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 
219 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  36.04 
 
 
212 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  37.21 
 
 
212 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  37.21 
 
 
233 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  36.63 
 
 
222 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  39.84 
 
 
211 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  34.5 
 
 
213 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  31.97 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  28.07 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  28.89 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.75 
 
 
219 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  26.75 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.75 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  26.75 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  26.75 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.75 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
225 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  26.75 
 
 
225 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  26.11 
 
 
219 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  26.71 
 
 
222 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 
224 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  23.32 
 
 
233 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  26.25 
 
 
254 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  25.81 
 
 
224 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
224 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  23.57 
 
 
1204 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 
218 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  22.17 
 
 
244 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  31.67 
 
 
268 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  29.52 
 
 
248 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  31.07 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  24.49 
 
 
238 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  20.54 
 
 
220 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  27.81 
 
 
202 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
230 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.58 
 
 
616 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>