77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4669 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  74.06 
 
 
212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  74.06 
 
 
212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  74.06 
 
 
212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  73.11 
 
 
212 aa  307  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  70.28 
 
 
212 aa  304  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  68.87 
 
 
212 aa  295  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  49.54 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  50.46 
 
 
213 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  48.58 
 
 
219 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  50 
 
 
211 aa  205  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  50.69 
 
 
212 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  50.69 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  50.23 
 
 
222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  44.19 
 
 
225 aa  191  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  42.63 
 
 
346 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  42.63 
 
 
346 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  42.63 
 
 
346 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  42.11 
 
 
346 aa  158  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  41.05 
 
 
350 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  38.33 
 
 
352 aa  148  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  40.24 
 
 
343 aa  129  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  32.58 
 
 
224 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  35.66 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  30.65 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  29.5 
 
 
233 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  30.48 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.97 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 
1204 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  33.33 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  32.11 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  32.69 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  32.09 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  31.15 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  31.61 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  37.3 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  29.38 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  29.74 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  31.16 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  28.39 
 
 
272 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  30.96 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  26 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  31.15 
 
 
546 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  23.31 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  32.52 
 
 
418 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  32.77 
 
 
412 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  32.5 
 
 
412 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
547 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  30.83 
 
 
421 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  31.09 
 
 
418 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  30.16 
 
 
543 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 
573 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  29.17 
 
 
744 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 
383 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.6 
 
 
776 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3342  hypothetical protein  29.58 
 
 
447 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.98 
 
 
460 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 
472 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 
380 aa  42  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
418 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4309  hypothetical protein  30.25 
 
 
455 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
418 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>