72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4762 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  56.25 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  40.93 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  41.85 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  39.37 
 
 		 1204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  40.72 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  40.72 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  37.16 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  37.56 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  41.67 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 		 224 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  40.41 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  37.61 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.65 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  40.65 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  40.65 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  40.65 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  37 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  40.65 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.65 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  40.19 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.19 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  40.19 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  38.12 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  34.22 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  32.8 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  32.8 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  31.84 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  31.63 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  31.63 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  30.21 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  31.47 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  34.96 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  29.51 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 		 212 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  25.64 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  28.96 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 		 547 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 546 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.5 
 
 		 418 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.19 
 
 		 759 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.19 
 
 		 755 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 		 425 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 425 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.25 
 
 		 412 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.52 
 
 		 751 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.33 
 
 		 712 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 418 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 		 573 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  30.3 
 
 		 534 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 418 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  22.5 
 
 		 412 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  28.24 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 328 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  27.17 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3253  von Willebrand factor type A  28.66 
 
 		 634 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0206278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  25.35 
 
 		 744 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 		 426 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 513 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>