77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3006 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  56.25 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  42.53 
 
 		 1204 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  45.75 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  44.13 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  44.13 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  42.79 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  40.09 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  40.93 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  46.26 
 
 		 254 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  38.6 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  42.34 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  42.34 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  42.34 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  39.25 
 
 		 224 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.34 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  41.89 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  41.89 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  41.89 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  41.89 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  41.89 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  38.89 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  38.86 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  33.64 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  31.28 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  31.28 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  31.77 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  31.77 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  31.77 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  30.3 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  30.05 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  31.4 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  31.92 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  28.28 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  32.65 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  28.71 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  28.65 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  28.11 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  26.71 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  29.3 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  23.75 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 		 546 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  26.47 
 
 		 477 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  25.83 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.19 
 
 		 680 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1510  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.836921  normal  0.0611826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1423  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 		 599 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  25.6 
 
 		 851 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  25.91 
 
 		 543 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 		 599 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 		 426 aa  45.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0446  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  26.95 
 
 		 592 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  37.08 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  27.16 
 
 		 383 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.65 
 
 		 759 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  29.41 
 
 		 744 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.44 
 
 		 420 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 		 419 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 547 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  24.39 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1580  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  30.51 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.924484  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.67 
 
 		 722 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.94 
 
 		 770 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 		 419 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.78 
 
 		 755 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  29.33 
 
 		 739 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 847 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  30.4 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>